244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6599 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  100 
 
 
375 aa  751    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  35.34 
 
 
351 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.6 
 
 
373 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.1 
 
 
375 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
373 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.93 
 
 
373 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
373 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
373 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
373 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
373 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
373 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  28.8 
 
 
373 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
373 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
373 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
373 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  28.8 
 
 
373 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 
373 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 
379 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
373 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.71 
 
 
373 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.71 
 
 
373 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.56 
 
 
373 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 
373 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  27.36 
 
 
375 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.99 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.04 
 
 
375 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.25 
 
 
373 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.01 
 
 
374 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.4 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 
372 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 
379 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
379 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 
383 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
383 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.32 
 
 
384 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.63 
 
 
379 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.03 
 
 
379 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.03 
 
 
379 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.2 
 
 
379 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 
505 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.26 
 
 
383 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  29.22 
 
 
283 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 
287 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.27 
 
 
384 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.44 
 
 
447 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 
288 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.16 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.91 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.27 
 
 
381 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 
383 aa  95.9  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  22.68 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  23.88 
 
 
439 aa  94  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  23.42 
 
 
439 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
283 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  27.74 
 
 
288 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  23.66 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.15 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  31.3 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  26.05 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  26.36 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  24.82 
 
 
706 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  28.84 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  21.97 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  40.91 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 
250 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  41.56 
 
 
95 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  27.91 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  25.67 
 
 
279 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  24.67 
 
 
371 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  24.38 
 
 
274 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  27.69 
 
 
281 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  24.77 
 
 
242 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  27.09 
 
 
250 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  28.22 
 
 
250 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
266 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  24.63 
 
 
344 aa  60.1  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  25.78 
 
 
321 aa  59.7  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  26.47 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  39.77 
 
 
93 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  26.78 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  39.47 
 
 
97 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  23.79 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  36.36 
 
 
101 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  37.66 
 
 
108 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  23.08 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  23.08 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>