54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2349 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  87.91 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  84.62 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  79.79 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  80.22 
 
 		 101 aa  144  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  36.78 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  41.18 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  36.78 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  38.82 
 
 		 95 aa  57  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  33.7 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  35.23 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 		 375 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  27.59 
 
 		 375 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.59 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.41 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.59 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  28.26 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  28.26 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  32.26 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  32.94 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 375 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  34.52 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  28.24 
 
 		 391 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  26.09 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.44 
 
 		 375 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 		 374 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  27.85 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  34.52 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  27.63 
 
 		 399 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.5 
 
 		 391 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  32.22 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  31.76 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.17 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.67 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  32.89 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  26.67 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  30.86 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  30.59 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  31.11 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  31.11 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  32.47 
 
 		 368 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1162  shikimate kinase / chorismate mutase  31.48 
 
 		 266 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  31.71 
 
 		 366 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 		 373 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.24 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 373 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.58 
 
 		 393 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  31.71 
 
 		 366 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.85 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  27.16 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2597  hypothetical protein  26.19 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.08 
 
 		 360 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>