More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1162 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1162  shikimate kinase / chorismate mutase  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  42.59 
 
 		 172 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  41.36 
 
 		 172 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  41.18 
 
 		 182 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  42.59 
 
 		 192 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  46.98 
 
 		 183 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  40.36 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  46.67 
 
 		 183 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  46.31 
 
 		 183 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  39.76 
 
 		 172 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  43.29 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  42.86 
 
 		 181 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  41.29 
 
 		 167 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  43.62 
 
 		 184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  40 
 
 		 172 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  40.12 
 
 		 172 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  40.12 
 
 		 172 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  45.18 
 
 		 191 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  42.94 
 
 		 190 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  40.74 
 
 		 180 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  39.88 
 
 		 190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  44.64 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  42.31 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  38.82 
 
 		 172 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  43.71 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  42.28 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  40.94 
 
 		 172 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  42.28 
 
 		 209 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  37.65 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  42.28 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  42.28 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  45 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  42.28 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  42.28 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  42.28 
 
 		 177 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  43.62 
 
 		 183 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  40.96 
 
 		 177 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  37.93 
 
 		 173 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  41.61 
 
 		 199 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  43.62 
 
 		 184 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  41.61 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  36.97 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  38.69 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  38.95 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.5 
 
 		 186 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  40 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  41.36 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  37.06 
 
 		 174 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  36.48 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  41.21 
 
 		 172 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  36.48 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  39.29 
 
 		 169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  40.24 
 
 		 172 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  37.36 
 
 		 173 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  40.88 
 
 		 189 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  43.87 
 
 		 179 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  35.76 
 
 		 176 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  39.51 
 
 		 172 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0371  shikimate kinase  45.07 
 
 		 169 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  36.78 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  36.78 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  43.87 
 
 		 179 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  36.78 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  42.95 
 
 		 184 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0280  Shikimate kinase  43.14 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2715  shikimate kinase  45.07 
 
 		 169 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  39.05 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0611  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  37.35 
 
 		 540 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.488786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  34.59 
 
 		 165 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  43.24 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5129  shikimate kinase  39.35 
 
 		 163 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  38.89 
 
 		 165 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  35.8 
 
 		 165 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  37.63 
 
 		 190 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  34.59 
 
 		 165 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  43.92 
 
 		 174 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  34.59 
 
 		 165 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3142  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 519 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  hitchhiker  0.00997966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  35.22 
 
 		 165 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  43.26 
 
 		 197 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  41.61 
 
 		 176 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  41.88 
 
 		 175 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  37.42 
 
 		 174 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  38.27 
 
 		 454 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  40.99 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>