108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0570 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  100 
 
 
105 aa  206  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  97.14 
 
 
105 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  97.14 
 
 
105 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  60.95 
 
 
106 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  52.22 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  51.58 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  45.16 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  46.59 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  43.18 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  44.19 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  41.67 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  42.22 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  41.57 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  42.05 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  41.11 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  41.11 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.89 
 
 
475 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  32.98 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  42.7 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  36 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.73 
 
 
358 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  36.17 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.73 
 
 
358 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  33.33 
 
 
101 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.36 
 
 
358 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  33.33 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  35.23 
 
 
105 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  39 
 
 
108 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.57 
 
 
375 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  34.57 
 
 
375 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 
375 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  32.98 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  33.7 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  33.7 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  35.23 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  35.11 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  31.71 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  31 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  32.98 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  34.04 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  34.04 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  34.52 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  33.71 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  46.34 
 
 
107 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  26.67 
 
 
399 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
379 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.31 
 
 
371 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  29.17 
 
 
125 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  31.31 
 
 
371 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  34.18 
 
 
372 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  31.71 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 
384 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  30.68 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
377 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  30.68 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  33.33 
 
 
386 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  31.76 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
383 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  31 
 
 
366 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.95 
 
 
375 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  28.71 
 
 
365 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  33.33 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.41 
 
 
360 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  34.41 
 
 
360 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  32.56 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  27.59 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  31.91 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  33.33 
 
 
360 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
379 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  32.91 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
384 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  41.51 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
379 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  21.59 
 
 
97 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  32.05 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  36.84 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
379 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
375 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
383 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
383 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
379 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
383 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  34.78 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
379 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 
379 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  30.11 
 
 
360 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.6 
 
 
393 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.23 
 
 
371 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  34.72 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  32.26 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  25.3 
 
 
384 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  30.86 
 
 
373 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
373 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
373 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>