53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2597 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2597  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2453  hypothetical protein  95.35 
 
 		 86 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  34.52 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  31.33 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  31.33 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  31.33 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.75 
 
 		 386 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 386 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  36.11 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.86 
 
 		 396 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  35.37 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  30.23 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  29.27 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  27.71 
 
 		 372 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  25.3 
 
 		 372 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.95 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32 
 
 		 372 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  34.18 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  27.38 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  31.51 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  33.8 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  30.59 
 
 		 456 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  29.76 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  31.65 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 393 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.77 
 
 		 659 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_002950  PG0885  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismate mutase  32.14 
 
 		 366 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  26.19 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  27.38 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  34.88 
 
 		 359 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  33.75 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1827  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.52 
 
 		 363 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.124092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1792  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.52 
 
 		 363 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  31.51 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  27.38 
 
 		 377 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 358 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.57 
 
 		 358 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  29.49 
 
 		 399 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  26.19 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  30.95 
 
 		 359 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  33.33 
 
 		 108 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>