76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  100 
 
 		 141 aa  279  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  66.36 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  63.39 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  59.57 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  59.79 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  57.89 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  53.61 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  52.58 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  51.35 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  54.81 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  60.87 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  63.64 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  59.14 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  57.78 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  59.14 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  58.62 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  58.62 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  56 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  56 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  54.08 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  52.73 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  57.61 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  54.55 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  54.55 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  56.32 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  46.88 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  60.71 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  54.22 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  52.08 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  55.95 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  54.32 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  54.32 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  54.32 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  52.56 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  48.72 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  48.72 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  33.33 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  33.33 
 
 		 399 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  47.27 
 
 		 355 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.33 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.67 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  26.74 
 
 		 456 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  33.33 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.82 
 
 		 393 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  30.49 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  28.16 
 
 		 379 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2453  hypothetical protein  31.51 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4394  DAHP synthetase I/KDSA  29.27 
 
 		 364 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.429892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  48.08 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2732  chorismate mutase  27.1 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0378476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0514  DAHP synthetase I/KDSA  31.19 
 
 		 360 aa  43.5  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  34.85 
 
 		 359 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  29.55 
 
 		 363 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2597  hypothetical protein  31.51 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 		 381 aa  42.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  34.55 
 
 		 357 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  38.71 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  30.43 
 
 		 346 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 		 387 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 		 375 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  33.8 
 
 		 357 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  34.67 
 
 		 357 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 377 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  40 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  38.96 
 
 		 371 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  39.22 
 
 		 295 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.96 
 
 		 371 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  37.21 
 
 		 372 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  35.29 
 
 		 295 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>