109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0958 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  67.86 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  66.36 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  65.56 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  55.1 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  57.73 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  55.1 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  60.44 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  60.22 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  57.58 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  56.07 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  56.07 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  57.84 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  57 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  60.23 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  60.64 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  60.64 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  52.73 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  58.24 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  55.21 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  56.38 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  55.21 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  59.3 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  60.92 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  49.52 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  60.47 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  50.51 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  50 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  52.33 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  41.67 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  54.32 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  54.32 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  54.32 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  50.53 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  53.75 
 
 		 98 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  50 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  33.33 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  38.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 374 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  28.4 
 
 		 456 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.06 
 
 		 381 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 		 371 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  36.54 
 
 		 357 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 		 375 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  30.43 
 
 		 375 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.07 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  27.59 
 
 		 374 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  30.67 
 
 		 333 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1647  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.29 
 
 		 359 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.639332  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0514  DAHP synthetase I/KDSA  29.9 
 
 		 360 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  39.39 
 
 		 366 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 		 384 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  30.85 
 
 		 379 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  30.38 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.59 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  32.94 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.6 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  25.97 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  31.58 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0046  chorismate mutase, putative  30.1 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52978  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  35.38 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.39 
 
 		 357 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  33.33 
 
 		 101 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2732  chorismate mutase  27.47 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0378476  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.39 
 
 		 357 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.39 
 
 		 357 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 383 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  28.42 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  35.19 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  28.4 
 
 		 367 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 383 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 383 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 383 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  37.04 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 		 377 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  31.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.78 
 
 		 375 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  38.78 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>