66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2357 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  100 
 
 		 101 aa  202  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  48.89 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  52.22 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  52.22 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  52.22 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  48.35 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  36.84 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  35.96 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  35.96 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  33.33 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  37.65 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  36.56 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  39.19 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  37.65 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  36.47 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  34.07 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  34.02 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  30.85 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.44 
 
 		 475 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  31.87 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  35.16 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  27.96 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  27.96 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  35.16 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  27.96 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  40.86 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  34.07 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  29.7 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.87 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  35 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.87 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 384 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  29.03 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.87 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  27.78 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  34.88 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  33.33 
 
 		 378 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  26.67 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  26.67 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 		 379 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 		 379 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  28.41 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  26.67 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.95 
 
 		 360 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 379 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 377 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 383 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  26.67 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 383 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 383 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 		 383 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  28.09 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 375 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  28.57 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.83 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4253  hypothetical protein  50 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  34.78 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  26.19 
 
 		 375 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  30.77 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>