64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0750 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  73.47 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  71.88 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  72.45 
 
 		 116 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  73.47 
 
 		 99 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  73.4 
 
 		 99 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  73.2 
 
 		 98 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  63.22 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  59.52 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  61.9 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  59.52 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  60 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  57.61 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  62.79 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  57.14 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  66.67 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  59.09 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  62.79 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  61.45 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  60.47 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  60.24 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  59.76 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  59.76 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  60.76 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  59.76 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  59.52 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  53.19 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  57.69 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  56.41 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  55.91 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  55.91 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  53.49 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  48.72 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  50 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  41.76 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  41.25 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  33.75 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 		 384 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  29.87 
 
 		 375 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 375 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40.79 
 
 		 375 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 377 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.38 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  31.76 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  32.1 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  36.36 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 		 381 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.93 
 
 		 375 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.81 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  31.11 
 
 		 374 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.81 
 
 		 358 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  31.17 
 
 		 373 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 373 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.29 
 
 		 374 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>