65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0521 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  100 
 
 
99 aa  198  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  34.52 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  57.5 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  32.47 
 
 
94 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  33.33 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  29.9 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  35.62 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  32.43 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  33.33 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  31.94 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  33.33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  31.46 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  31.94 
 
 
99 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  31.94 
 
 
99 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  33.33 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  33.33 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  31.08 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  32.88 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42 
 
 
357 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  32.86 
 
 
333 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42 
 
 
357 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  28 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  37.1 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  32.43 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  31.15 
 
 
374 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  33.33 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  30.12 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  32.43 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  30 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  32.43 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
357 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  29.07 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  33.78 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  41.67 
 
 
355 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  31.08 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.36 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.54 
 
 
359 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  31.94 
 
 
104 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  42 
 
 
360 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.43 
 
 
360 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  30.3 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  33.33 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30 
 
 
375 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  30.3 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  47.5 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.18 
 
 
370 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 
375 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  36.36 
 
 
377 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.78 
 
 
360 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.22 
 
 
357 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.13 
 
 
359 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  41.3 
 
 
363 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2998  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.746769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2748  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.531887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2698  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2677  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.907033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2958  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3004  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2960  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2957  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.64747e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  31.82 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  27.78 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4791  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  40 
 
 
357 aa  40  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2280  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  42.86 
 
 
358 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>