89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4585 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  51.69 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  34.12 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  32.94 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  35.8 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  31.76 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  29.03 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  29.03 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  28.4 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  32.47 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2346  Chorismate mutase  28.57 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  32.5 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  33.75 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  29.27 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  31.25 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  29.07 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  32.5 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  32.5 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0885  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismate mutase  30.49 
 
 		 366 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  28.75 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  32.47 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  29.63 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.49 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  29.33 
 
 		 372 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  23.26 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  26.6 
 
 		 374 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  32.53 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  32.53 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  25.27 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  28.24 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  25.27 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1162  shikimate kinase / chorismate mutase  26.25 
 
 		 266 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 372 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  27.63 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  32 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  28.92 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  28.21 
 
 		 399 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  23.86 
 
 		 386 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  25.88 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07385  putative chorismate mutase  21.35 
 
 		 360 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28 
 
 		 358 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  31.58 
 
 		 232 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28 
 
 		 358 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28 
 
 		 358 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1735  chorismate mutase  29.41 
 
 		 94 aa  43.5  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  23.53 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  25.97 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  24.68 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  33.33 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  25.88 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  23.53 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  31.76 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  24.71 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  29.49 
 
 		 648 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  29.07 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  25 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2583  prephenate dehydratase  28.92 
 
 		 372 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  27.27 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  25 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  23.91 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  26.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  26.09 
 
 		 363 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  26.97 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  22.37 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  32.65 
 
 		 373 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  26.97 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  24.44 
 
 		 391 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.62 
 
 		 375 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  26.32 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  30.49 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  27.71 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 		 373 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  22.37 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  24.42 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  25.64 
 
 		 103 aa  40  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  25.97 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.92 
 
 		 659 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  23.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>