78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3570 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  100 
 
 		 102 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  99.02 
 
 		 232 aa  203  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  64.52 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  54.17 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  44.79 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  44.79 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  48.24 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  45.24 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  40 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  45.12 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  41.24 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  42.68 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  37.65 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  34.12 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  34.12 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  41.67 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  47.62 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  34.07 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  32.29 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  40.24 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  39.53 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  39.33 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  39.13 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  46.15 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  37.21 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  36.26 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  34.12 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  36.9 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  39.77 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  36.47 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  32.61 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  32.56 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  33.77 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  37.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  35.71 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  32.47 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  33.33 
 
 		 413 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  35.71 
 
 		 397 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  32 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  33.73 
 
 		 372 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  33.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  36.9 
 
 		 402 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  35.29 
 
 		 399 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 384 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  33.33 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.21 
 
 		 365 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 375 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  36.9 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  34.52 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2904  Chorismate mutase  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  43.1 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  32.14 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2734  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.26 
 
 		 360 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 358 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 358 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.49 
 
 		 375 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.23 
 
 		 367 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  37.35 
 
 		 366 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 360 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0697  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  30.77 
 
 		 360 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.92 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.59 
 
 		 393 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  27.78 
 
 		 367 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2533  Chorismate mutase  32.93 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 375 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0675  hypothetical protein  30.85 
 
 		 297 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.14 
 
 		 370 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  34.52 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.89 
 
 		 391 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  34.83 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>