41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2939 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  100 
 
 		 90 aa  178  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  40.24 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  37.5 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  36.47 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.63 
 
 		 475 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  36.05 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  39.02 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  38.64 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  32.05 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  36.47 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  32.56 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  36.47 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  24.71 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.1 
 
 		 372 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  32.53 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.94 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  34.12 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  32.93 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  33.77 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  33.77 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 358 aa  43.5  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  34.18 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  29.07 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  30.49 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  32.47 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  23.53 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  28.05 
 
 		 109 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  29.89 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  33.78 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  27.5 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  35.06 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  36.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.38 
 
 		 393 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  35.56 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  35.56 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  31.08 
 
 		 96 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 		 375 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  32.53 
 
 		 375 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>