36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3678 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  100 
 
 		 165 aa  304  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  39.74 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  39.74 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  41.89 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  41.98 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  39.36 
 
 		 105 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.73 
 
 		 475 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  43.42 
 
 		 109 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  33.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  36.71 
 
 		 386 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  39.51 
 
 		 93 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  39.02 
 
 		 101 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  33.33 
 
 		 106 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  38.81 
 
 		 102 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  37.31 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  40 
 
 		 109 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  40.28 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  36.36 
 
 		 101 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  35.29 
 
 		 106 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  38.27 
 
 		 101 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  35.29 
 
 		 106 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  36.76 
 
 		 108 aa  44.3  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  37.04 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  37.04 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 		 375 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  38.67 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  37.14 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  37.84 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  40 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  40 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  34.67 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  31.51 
 
 		 107 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  38.96 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  36.49 
 
 		 101 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  37.97 
 
 		 108 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 		 375 aa  40.8  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>