49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3271 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  100 
 
 		 109 aa  219  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  59.14 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  53.26 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  52.08 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  45.56 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  42.27 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  45.65 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  46.67 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  44.44 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  44.44 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  41.94 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  38.78 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  45.05 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  39.13 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  36.47 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.5 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  38.14 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  39.24 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  32.58 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  43.96 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  43.96 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  43.96 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  39.29 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  28.87 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  34.07 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  29.35 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  27.84 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  34.48 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  27.84 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  27.84 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  27.84 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  34.88 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  27.84 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  38.71 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  28.26 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  28.26 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  28.41 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  31.65 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  28.42 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  28.41 
 
 		 371 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  28.05 
 
 		 90 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.33 
 
 		 370 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  28.41 
 
 		 371 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 360 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  32.22 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  30.12 
 
 		 360 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  31.71 
 
 		 382 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  30.43 
 
 		 95 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>