41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0753 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  64.76 
 
 		 117 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  67.68 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  67.68 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  52.53 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  48.51 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  45.65 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  37.38 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  46.24 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  38.61 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  38.2 
 
 		 101 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  34.69 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.78 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  36.26 
 
 		 102 aa  57  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  35.16 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  39.77 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  26.37 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  41.24 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  30.39 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  36.96 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  30.85 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  31.33 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  36.25 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  31.68 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  31.68 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  32.93 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  42.05 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  40.91 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  40.91 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  32.29 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  32.39 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  28.72 
 
 		 101 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  26.83 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  29.17 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  28.12 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  28.12 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  29.17 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  28.05 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.89 
 
 		 371 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  30.93 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2844  hypothetical protein  35.23 
 
 		 175 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456155  normal  0.0935837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>