47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2321 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  100 
 
 		 108 aa  216  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  78.3 
 
 		 107 aa  168  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  42.68 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  41.46 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  38.37 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  40.48 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  39.78 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.77 
 
 		 475 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  37.35 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  32.93 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  32.05 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  38.27 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.51 
 
 		 372 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  34.94 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  33.72 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  28.75 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  36.36 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  28.75 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  35.8 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  38.55 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  34.62 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  30.86 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  31.71 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  30.86 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  34.62 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.62 
 
 		 375 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  33.75 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  34.62 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  28.57 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  30.38 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  31.65 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 375 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  29.35 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  34.25 
 
 		 375 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  31.71 
 
 		 105 aa  43.5  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  30.26 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  29.87 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  32 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  32.39 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  31.17 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 384 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  26.97 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  27.71 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  29.35 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  33.33 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 373 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>