49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0569 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  100 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  45.36 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  45.83 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  45.83 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  37.38 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  42.05 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  41.24 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  44.68 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  46.34 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  41.94 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  40.43 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  41.67 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  53.41 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  40.48 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  46.75 
 
 		 475 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  38.32 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  30.53 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  37.89 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  43.53 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  32.65 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  30.34 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  36.56 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  30.34 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  36.67 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  29.73 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  38.64 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  32.65 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  33.72 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  32.65 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  31.63 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  31.63 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  31.63 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  32.18 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  31.63 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  34.12 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  32.93 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  32.93 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  35.29 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  40.7 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  29.52 
 
 		 386 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  40.91 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  40.91 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  31.31 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  32.08 
 
 		 374 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  32.08 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  34.09 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  29.89 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  25.96 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>