77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2596 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  100 
 
 		 106 aa  219  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  50 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  52.63 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  51.04 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  48.96 
 
 		 101 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  49.47 
 
 		 101 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  49.47 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  49.47 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  49.47 
 
 		 101 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  47.37 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  47.37 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  47.37 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  39.39 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  39.39 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  52.27 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  34.62 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  36.46 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.96 
 
 		 475 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  32.29 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  32.63 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  32.58 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  33.67 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  31.52 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  28.85 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.17 
 
 		 375 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  28.12 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  28.16 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 		 384 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 373 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 		 375 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  36.67 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 373 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  32.98 
 
 		 375 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 373 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 373 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 373 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 381 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  28.87 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 375 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  30.95 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 		 377 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  32.93 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  29.03 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  32.93 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  30.38 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  30.86 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  30.86 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  29.07 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  32.1 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.68 
 
 		 379 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.89 
 
 		 374 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 		 373 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  32.93 
 
 		 116 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  32.56 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  32.58 
 
 		 165 aa  40.8  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.67 
 
 		 357 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  31 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.67 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 		 379 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 		 379 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 		 373 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  31.17 
 
 		 359 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>