52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4076 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  56.99 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  54.17 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  57.14 
 
 		 232 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  46.67 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  49.5 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  42.86 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.33 
 
 		 475 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  43.88 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  46.34 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  41.38 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  36.46 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  41.94 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  35.63 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  34.41 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  41.94 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  40.22 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  37.5 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  39.78 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  36.36 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  36.36 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  36.36 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  39.51 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  39.24 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  30.39 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  39.58 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  28.26 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  28.26 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  31.82 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  33.33 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  37.8 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  36.46 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  35.9 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  34.57 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  35.44 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  32.1 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  32.1 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  32.1 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  33.33 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  33.33 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  32.35 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  32.05 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  47.06 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 386 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  34.88 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  30.77 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  41.77 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  32.58 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  27.5 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  40.35 
 
 		 374 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  40.35 
 
 		 374 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  35.16 
 
 		 147 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>