38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0443 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  100 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  80.19 
 
 		 114 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  80.19 
 
 		 114 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  64.76 
 
 		 116 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  50.5 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  51.06 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  45.36 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  46.67 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  42.86 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  45.24 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  44.05 
 
 		 232 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  45.05 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  35.71 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.86 
 
 		 475 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  38.95 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  42.7 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  41.24 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  29.67 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  46.46 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  39.33 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  37.65 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  35.71 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  30 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  30 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  44.71 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  43.53 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  43.53 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  32.18 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  27.59 
 
 		 386 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  31.71 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  34.12 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  26.32 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  27.72 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  32.22 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  26.32 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.88 
 
 		 367 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>