51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1139 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  100 
 
 		 108 aa  215  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  46.15 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  47.25 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  44.33 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  38.78 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  38.32 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  40.91 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.3 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  40.91 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  44.32 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  34.09 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  35.96 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  42.11 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  39.77 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  39.33 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  42.53 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  39.6 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  33.33 
 
 		 232 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  36.36 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  32.56 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  28.87 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  34.94 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  31.76 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  26.97 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  36.56 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  30.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  30.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  39 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  25.84 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  30.59 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  29.55 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  37 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  32.56 
 
 		 659 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  37 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  28.09 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  29.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  29.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  31.4 
 
 		 664 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  29.07 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  31.4 
 
 		 664 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  29.55 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  31.4 
 
 		 664 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  31.4 
 
 		 664 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.4 
 
 		 667 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.4 
 
 		 667 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  31.4 
 
 		 667 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0514  DAHP synthetase I/KDSA  26.14 
 
 		 360 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  29.35 
 
 		 384 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  29.11 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  27.91 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  27.16 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>