49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2047 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  100 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  78.3 
 
 		 108 aa  168  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  45.12 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  43.9 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  40.7 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  40.21 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  39.02 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.66 
 
 		 475 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  40.22 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  37.5 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  39.51 
 
 		 372 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  37.36 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  37.78 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  36.73 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  33.71 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  36.14 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  36.14 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  27.78 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  35.71 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  28.89 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  31.11 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  27.5 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  27.5 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  27.78 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  34.12 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  30 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  30 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  27.78 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  27.66 
 
 		 101 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  30.95 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  28.89 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  36.25 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  27.66 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.62 
 
 		 375 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  34.15 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 375 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.23 
 
 		 373 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  34.25 
 
 		 375 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  31.71 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  30.34 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.78 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  28.42 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  33.73 
 
 		 106 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  31.88 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  31.52 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  30 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 384 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28 
 
 		 374 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>