43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3365 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  99.01 
 
 		 101 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  94.06 
 
 		 101 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  85.15 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  85.15 
 
 		 101 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  84.16 
 
 		 101 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  82.18 
 
 		 101 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  73.27 
 
 		 101 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  71.29 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  55 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  49.47 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  41.76 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  41.76 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  50 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  41.76 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  30.95 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  30.95 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  32.26 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.33 
 
 		 475 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  27.66 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  32.65 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  33.73 
 
 		 386 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  27.78 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  32.1 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  26.04 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  33.7 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  30.3 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 		 375 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 381 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 		 373 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  31.96 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  30.93 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  29.55 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.21 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  30.93 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  26.67 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.74 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  25 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 		 373 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 		 375 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>