31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3009 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  100 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  56.25 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  51.02 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  50 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  50 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  50 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  52.27 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  47.96 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  47.96 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  48.98 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  46.94 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  48.98 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  51.58 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  40.86 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  40.86 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.2 
 
 		 475 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  32.32 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  37.21 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  35.8 
 
 		 386 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  29.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  31.46 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  29.29 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  31.76 
 
 		 232 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  32.14 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  34.57 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  30.38 
 
 		 367 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  30.69 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  35.16 
 
 		 106 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  26 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  32.69 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  28.72 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>