37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1986 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  100 
 
 		 108 aa  216  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  59.14 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  53.26 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  53.06 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  46.15 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  45.16 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  41.24 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  41.41 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  41.41 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  33 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  38.61 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  37.78 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  38.95 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  38.37 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  37.21 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  35.96 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  36.05 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  41.38 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.97 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  42.22 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  28.12 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  41.11 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  41.11 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  34.88 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  37.5 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  33.71 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  35.9 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  26.67 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  31.58 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  29.35 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  34.09 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  27.47 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  27.47 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  30.49 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  29.29 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  26.88 
 
 		 384 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  32.18 
 
 		 362 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>