35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0870 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  100 
 
 		 102 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  94.06 
 
 		 101 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  71.29 
 
 		 101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  71.29 
 
 		 101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  71.29 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  69.31 
 
 		 101 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  69.31 
 
 		 101 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  68.32 
 
 		 101 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  68.32 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  68.32 
 
 		 101 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  55.67 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  51.04 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  39.56 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  51.58 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  39.56 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  40.22 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  31.03 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  32.26 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  30.61 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  32.61 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  35.44 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  27.84 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  31.87 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  27.66 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.4 
 
 		 475 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  32.22 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  29.67 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  31.94 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  28.26 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  34.38 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  30.12 
 
 		 386 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  32.43 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  35.63 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  37.66 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  30.56 
 
 		 136 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>