67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3397 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  100 
 
 		 108 aa  213  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  84.55 
 
 		 108 aa  174  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  77 
 
 		 101 aa  157  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  84.62 
 
 		 95 aa  150  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  79.79 
 
 		 97 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  39.53 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  38.75 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.18 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.03 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.18 
 
 		 358 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  37.18 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  36.76 
 
 		 375 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  33.33 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  30.77 
 
 		 399 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  33.75 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  36.36 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  32.61 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  36.71 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.27 
 
 		 391 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  28.92 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  34.44 
 
 		 372 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  27.85 
 
 		 391 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  31.65 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  30.59 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  34.88 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 393 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  28.95 
 
 		 294 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  29.41 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  34.21 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.57 
 
 		 386 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  32.5 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  32.18 
 
 		 386 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.38 
 
 		 375 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  34.21 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  28.38 
 
 		 375 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 386 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.26 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.26 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  28.41 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.38 
 
 		 377 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  29.67 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  29.41 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  28.41 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.73 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  32.38 
 
 		 403 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  30.23 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  30.59 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  29.89 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  28.75 
 
 		 413 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.38 
 
 		 375 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  25 
 
 		 662 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.89 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  28.09 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  25 
 
 		 664 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  25 
 
 		 664 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  25 
 
 		 664 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  25 
 
 		 664 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  24.68 
 
 		 648 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 		 375 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  34.21 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  25 
 
 		 659 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  27.63 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  22.37 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.23 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 393 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  27.63 
 
 		 295 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>