65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0155 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  100 
 
 		 94 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  45.74 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  47.31 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  45.88 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  40.43 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  41.3 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  41.38 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  37.21 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  36.78 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  32.14 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  32.14 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  30.95 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  40.3 
 
 		 375 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  36.05 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  34.88 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  33.33 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  30.95 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.92 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  31.46 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  30.77 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  31.91 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  29.49 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  27.63 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  31.91 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  25.88 
 
 		 358 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  26.37 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3343  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  26.14 
 
 		 357 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0172834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.88 
 
 		 358 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.89 
 
 		 375 aa  44.3  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.26 
 
 		 667 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36 
 
 		 384 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 667 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  30.67 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.26 
 
 		 667 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  28.21 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 671 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  25.88 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  32.81 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  28.09 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  25.35 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  33.33 
 
 		 355 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36 
 
 		 377 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  28.95 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.72 
 
 		 360 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 393 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  28.95 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.48 
 
 		 357 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.95 
 
 		 386 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  32 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  28.95 
 
 		 659 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  27.4 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 386 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  38.89 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  32.88 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.63 
 
 		 357 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.63 
 
 		 357 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.86 
 
 		 367 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.69 
 
 		 375 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.77 
 
 		 475 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>