60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1988 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  100 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  45.74 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  42.86 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  43.82 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1353  chorismate mutase  39.77 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.397236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  32.22 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3126  chorismate mutase  38.2 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  38.75 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  38.37 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  37.21 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  36.59 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  23.81 
 
 		 358 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  34.07 
 
 		 380 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.07 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 386 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 386 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  25 
 
 		 358 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  36.78 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.43 
 
 		 659 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  31.71 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  30.38 
 
 		 648 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 393 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  37.97 
 
 		 333 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1059  chorismate mutase  32.43 
 
 		 657 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.850871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2747  chorismate mutase  31.08 
 
 		 662 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.27 
 
 		 385 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  25 
 
 		 358 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  25.64 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1264  chorismate mutase  31.08 
 
 		 664 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.728983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1297  chorismate mutase  30.38 
 
 		 664 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  36.36 
 
 		 375 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3093  chorismate mutase  30.38 
 
 		 664 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0115511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1220  chorismate mutase  30.38 
 
 		 664 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1177  chorismate mutase  30.38 
 
 		 659 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.38 
 
 		 667 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  31.08 
 
 		 667 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.38 
 
 		 671 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  25.93 
 
 		 391 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 391 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.33 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  31.33 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  30 
 
 		 346 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  31.08 
 
 		 654 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  31.4 
 
 		 386 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  33.33 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  29.11 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.56 
 
 		 667 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  28.57 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  28.77 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  29.07 
 
 		 374 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  34.52 
 
 		 105 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>