80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2346 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2346  Chorismate mutase  100 
 
 
104 aa  210  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  34.41 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  34.04 
 
 
368 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0885  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismate mutase  40.7 
 
 
366 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  29.35 
 
 
367 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4394  DAHP synthetase I/KDSA  37.04 
 
 
364 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.429892  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  32.22 
 
 
363 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  28.57 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0514  DAHP synthetase I/KDSA  31.76 
 
 
360 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.73 
 
 
360 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  33.7 
 
 
379 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  36.25 
 
 
360 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  35.59 
 
 
374 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35 
 
 
360 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  34.83 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  35 
 
 
360 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  44.44 
 
 
355 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  33.33 
 
 
365 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  36.14 
 
 
351 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.59 
 
 
370 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.26 
 
 
384 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2904  Chorismate mutase  36.84 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  31.82 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  33.75 
 
 
333 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.89 
 
 
359 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.89 
 
 
360 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  42.59 
 
 
362 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  28.74 
 
 
384 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  32.47 
 
 
366 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3232  chorismate mutase  33.8 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  32 
 
 
366 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.85 
 
 
393 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  32.39 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  44 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  31.25 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.99 
 
 
358 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  37.5 
 
 
381 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  31.25 
 
 
94 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  33.33 
 
 
373 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.24 
 
 
373 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  34.72 
 
 
366 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  23.17 
 
 
346 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  39.13 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  32.91 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.66 
 
 
659 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  38.89 
 
 
359 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  26.19 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  32.5 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.88 
 
 
375 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  31.51 
 
 
359 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.94 
 
 
375 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  29.9 
 
 
110 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>