62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4431 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  100 
 
 		 90 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  53.66 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  51.22 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  47.62 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  52.44 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  50.68 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  50.68 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  38.3 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  48.65 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  46.99 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  44 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  50.68 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  46.84 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  53.03 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  45.61 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  40.96 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  45.61 
 
 		 360 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  35.63 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  42.11 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.11 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  42.11 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  42.11 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  42.11 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  42.11 
 
 		 362 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 		 381 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  40.35 
 
 		 360 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.1 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.51 
 
 		 358 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.51 
 
 		 358 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 358 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  34.38 
 
 		 366 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  35.71 
 
 		 372 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  38.98 
 
 		 359 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.55 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 357 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  46.15 
 
 		 371 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  31.65 
 
 		 382 aa  42  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  45.28 
 
 		 397 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 357 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 357 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  30.99 
 
 		 373 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2346  Chorismate mutase  39.13 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  33.82 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  35.59 
 
 		 333 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  36.84 
 
 		 359 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0697  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  33.33 
 
 		 360 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  38.78 
 
 		 360 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>