21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1335 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  100 
 
 		 119 aa  233  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  65.38 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  74.63 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  59.76 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  70.42 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  73.61 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  67.47 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  67.47 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  67.47 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  69.7 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  41.96 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  50 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  50 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  55.26 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  46.25 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  43.06 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  41.56 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  39.47 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  40.74 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>