32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1860 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  100 
 
 		 92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  81.01 
 
 		 94 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  79.73 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  79.73 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  79.73 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  75.34 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  60 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  61.11 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  72.73 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  73.61 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  49.43 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  50.54 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  44.58 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  47.37 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  48.48 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  50 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  38.16 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.31 
 
 		 359 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  31.58 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  38.89 
 
 		 346 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.33 
 
 		 386 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.93 
 
 		 358 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.55 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.59 
 
 		 358 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  40.38 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.59 
 
 		 358 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 357 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 357 aa  40.4  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  30.65 
 
 		 456 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>