60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  100 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  68.29 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  55.29 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  56.41 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  58.23 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  66.15 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  59.74 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  62.12 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  62.12 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  62.12 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  57.14 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  52.44 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  41.11 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  44.32 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  48.53 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  41.46 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  40.23 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.38 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.38 
 
 		 358 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.66 
 
 		 358 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  40.74 
 
 		 294 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  42.59 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  41.43 
 
 		 355 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  35.48 
 
 		 359 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  38.1 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.79 
 
 		 359 aa  47  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  34.25 
 
 		 413 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.88 
 
 		 387 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  37.29 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  41.67 
 
 		 365 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  40.98 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.3 
 
 		 381 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  38.89 
 
 		 295 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  38.98 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  41.67 
 
 		 375 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.17 
 
 		 371 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.54 
 
 		 371 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  29.17 
 
 		 371 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  36.21 
 
 		 355 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  40.68 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  35.21 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  36.92 
 
 		 359 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1193  chorismate mutase  36.51 
 
 		 366 aa  42.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  39.22 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.11 
 
 		 367 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.62 
 
 		 373 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.31 
 
 		 362 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  41.51 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.48 
 
 		 360 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  35.82 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  32.43 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  40.74 
 
 		 419 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  29.85 
 
 		 366 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  31.51 
 
 		 373 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  35.71 
 
 		 346 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2751  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  36.07 
 
 		 358 aa  40  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  40.32 
 
 		 379 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  37.5 
 
 		 295 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>