31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10966 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  68.82 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  68.82 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  68.82 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  66.27 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  75.34 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  67.53 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  74.65 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  72.73 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  51.11 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  69.7 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  48.72 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  52.38 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  50 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  55.56 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  43.75 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  39.24 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  44.44 
 
 		 346 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  39.66 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  39.66 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  34.48 
 
 		 351 aa  41.6  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  31.34 
 
 		 365 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  35.29 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.93 
 
 		 384 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  42.31 
 
 		 103 aa  40  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.9 
 
 		 382 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 375 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>