26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6514 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  100 
 
 		 96 aa  187  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  68.29 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  63.89 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  69.7 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  69.7 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  69.7 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  57.32 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  56.41 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  54.55 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  50.57 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  62.32 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  41.86 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  39.77 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  47.89 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  50.68 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  44.29 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  41.46 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  38.37 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  37.63 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.48 
 
 		 359 aa  47  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  31.51 
 
 		 359 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.74 
 
 		 358 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.21 
 
 		 358 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  39.34 
 
 		 294 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  32.73 
 
 		 346 aa  40  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>