30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4208 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  100 
 
 		 112 aa  217  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  88.39 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  62.5 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  53.66 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  39.77 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  41.11 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  43.01 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  46.25 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  41.56 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  42.42 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  42.7 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  38.64 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  39.33 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  43.94 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  40.91 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  42.86 
 
 		 359 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  41.18 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  41.82 
 
 		 359 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  38.98 
 
 		 372 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.35 
 
 		 362 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  38.18 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  37.74 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.29 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.38 
 
 		 371 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.29 
 
 		 358 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  39.29 
 
 		 358 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>