21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4417 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  68.82 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  80.28 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  80.82 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  71.43 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  64.94 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  74.24 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  67.47 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  54.32 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  50 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  50 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  53.95 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  48.61 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  46.77 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  45.83 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  40.79 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35 
 
 		 359 aa  42.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  32.89 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>