20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0370 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  100 
 
 		 110 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  44.32 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  46.48 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  43.02 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  47.89 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  44 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  44.29 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  41.11 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  42.53 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  48.53 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  39.33 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  45.83 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  49.21 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  33.33 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  47.62 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  45.45 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  47.62 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  47.62 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  48.33 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  31.15 
 
 		 333 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>