42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3331 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  100 
 
 		 94 aa  179  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  54.17 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  61.8 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  62.2 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  74.63 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  72.73 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  74.24 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  74.24 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  74.24 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  72.73 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  52.38 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  51.11 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  47.06 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  53.01 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  48.68 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  45.07 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.07 
 
 		 359 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  42.22 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  36.78 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.66 
 
 		 358 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  40 
 
 		 346 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  35.8 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.78 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 382 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  36.07 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  40.74 
 
 		 295 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 379 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.21 
 
 		 358 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.21 
 
 		 358 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  34.43 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  33.9 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2475  chorismate mutase  33.77 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  36.21 
 
 		 419 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>