35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3818 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  88.39 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6087  chorismate mutase  61.36 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  51.22 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  41.86 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  44.29 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  46.05 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  41.46 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3331  chorismate mutase  45.83 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  39.73 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  42.42 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  41.11 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  41.86 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  43.94 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  41.43 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  42.86 
 
 		 359 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  38.89 
 
 		 366 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  41.82 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  37.04 
 
 		 359 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0336  chorismate mutase  38.81 
 
 		 419 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.35 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  40.35 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 362 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  32.26 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  36.36 
 
 		 355 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  34.43 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 358 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  43.94 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 358 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.5 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 372 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>