17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3815 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280369  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0903  hypothetical protein  76.74 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1021  hypothetical protein  46.91 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  0.027599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0370  chorismate mutase  43.02 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  41.86 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6514  chorismate mutase  41.46 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3818  chorismate mutase  41.86 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4431  chorismate mutase  40.96 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1256  chorismate mutase  38.16 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0645923  normal  0.370124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4208  chorismate mutase  40.91 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1860  chorismate mutase  40.91 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803803  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10966  hypothetical protein  37.68 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.341094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4874  chorismate mutase  40.91 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.546771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4711  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4417  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4331  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0254117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1335  chorismate mutase  40.91 
 
 		 119 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>