More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002034 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  93.41 
 
 		 258 aa  500  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  33.99 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  35.15 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  34.87 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  33.88 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  34.14 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  34.03 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  33.07 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  32.2 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  33.08 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  34.34 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  32.71 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  32.33 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  29.02 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  34.04 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  34.04 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  34.04 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  33.07 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  30.68 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  30.6 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  32.13 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  32.67 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  33.19 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  30.04 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  33.05 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  31.49 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  31.44 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  32.34 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  28.68 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  28.09 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  30.35 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  28.26 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  25.39 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  25 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.92 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.37 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  27.9 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  26.53 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  33.53 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  28.12 
 
 		 421 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 306 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.57 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  26.45 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.11 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.78 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.1 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1517  ABC transporter extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0341163  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  26.23 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  29.01 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  32.93 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.73 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  28.68 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.91 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.06 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.06 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  27.06 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.85 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>