More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3631 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  45.56 
 
 		 273 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  42.62 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  44.67 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  36.53 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  30.31 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  26.67 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  25.73 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  32.73 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.16 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.37 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.98 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.98 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.91 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  32.12 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  29.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.23 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.15 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.11 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  25.86 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.19 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.63 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  23.79 
 
 		 990 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  26.63 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  28.79 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1594  arginine-binding protein  32.17 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  23.79 
 
 		 990 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.03 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.03 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  24.9 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  28.25 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  26.48 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  26.38 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  26.13 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  26.56 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  26.56 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  29 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  26.56 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.85 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.87 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.3 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.57 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  26.18 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0591  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  31.47 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0748117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.3 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.42 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  29.3 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>