More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3640 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
303 aa  613  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  70.82 
 
 
306 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  51.42 
 
 
302 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  48.93 
 
 
302 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  48.93 
 
 
302 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  44.52 
 
 
295 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
303 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  37.79 
 
 
299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  37.79 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  37.37 
 
 
298 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  36.27 
 
 
300 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  34.15 
 
 
285 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
285 aa  148  9e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 
276 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2073  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 
286 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  28.9 
 
 
272 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  28.9 
 
 
272 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
295 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  28.26 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  28.91 
 
 
305 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  28.91 
 
 
305 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  28.91 
 
 
305 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
271 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
296 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  28.57 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  28.67 
 
 
271 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  26.71 
 
 
302 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  27.62 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  27.62 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  27.62 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  27.51 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  27.62 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  26.32 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  26.32 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  26.04 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  26.49 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.31 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  26.32 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.52 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  25.94 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  25.94 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  25.94 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  25.17 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.49 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.17 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  25.6 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.17 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  25.58 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  25.58 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.58 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  25.58 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.58 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.58 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  25.58 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  26.79 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  26.09 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  26.33 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.87 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  24.72 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  26.57 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  25.26 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.88 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  26.3 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  26.24 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  26.24 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  26.3 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>