186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0599 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2073  extracellular solute-binding protein  58.27 
 
 		 286 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  43.77 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  33.89 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  35.98 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  29.37 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  28.06 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  26.03 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  23.46 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  22.9 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  22.9 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  21.4 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  26.51 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  24.88 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.65 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.13 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.13 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.13 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.61 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  24.17 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.79 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.41 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 931 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  24.17 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0984  extracellular solute-binding protein family 3  27.14 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  29.23 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  27.22 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  23.64 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  23.85 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.88 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  22.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  22.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  32.81 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0973  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.36 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00938185  normal  0.751269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.3 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.79 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.5 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.42 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  28.07 
 
 		 934 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.88 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  22.82 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3008  extracellular solute-binding protein family 3  20.26 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.22 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  23.53 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  25.32 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.27 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.22 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  24.32 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1634  subunit of the multisubunit Na+/H+ antiporter-like protein  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  23.96 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.82 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4074  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  27.02 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>