More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0965 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  77.45 
 
 		 279 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5536  extracellular solute-binding protein family 3  77.45 
 
 		 279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901177  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  79.53 
 
 		 280 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  69.57 
 
 		 282 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2775  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.31 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.550613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  69.34 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3379  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.35 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  29.04 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.16 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.06 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.74 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.37 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 246 aa  99  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.27 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.72 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.52 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  29.28 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  28.9 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  32.03 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  28.99 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  28.34 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.69 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.81 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  24.82 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.54 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.54 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  28.67 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  25.74 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.51 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  26.57 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  26.2 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  30.23 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.61 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  30.23 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  30.23 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  26.2 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  30.23 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  30.23 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  29.59 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.35 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 271 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 268 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.04 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  26.34 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  27.82 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  27.74 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.28 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.52 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  28.43 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.66 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>