More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1430 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  85.71 
 
 		 294 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  56.04 
 
 		 296 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  55.68 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  53.97 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  52 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  55.25 
 
 		 290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  54.74 
 
 		 294 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  58.37 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  51.9 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  47.22 
 
 		 275 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  47.22 
 
 		 275 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  47.22 
 
 		 275 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  46.92 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  50.63 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  44.13 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  43.48 
 
 		 289 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  45.42 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  45.17 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 		 321 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  51.34 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  49.78 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  47.23 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  38.62 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 		 282 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.68 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  46.15 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  42.92 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  35.96 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  44.9 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  42.51 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  38.93 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  42.56 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  43.69 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  37.81 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  38.34 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  40.25 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.77 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  37.08 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  36.68 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  33.99 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 		 277 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  33.82 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  35.32 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.45 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.45 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.45 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  36.91 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.59 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.09 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  31.65 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  34.63 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  37.37 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.55 
 
 		 751 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.47 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.99 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.33 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  30.32 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.5 
 
 		 600 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.78 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  31.62 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5536  extracellular solute-binding protein family 3  31.01 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901177  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.42 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>