More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1043 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
278 aa  548  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  56.31 
 
 
274 aa  261  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  56.54 
 
 
259 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  56.96 
 
 
259 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  56.54 
 
 
259 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  47.55 
 
 
264 aa  255  6e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  45.45 
 
 
277 aa  206  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  40.29 
 
 
286 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.51 
 
 
266 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  39.11 
 
 
281 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  40.86 
 
 
275 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.14 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  40.14 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.14 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.78 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.14 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  39.78 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.78 
 
 
276 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.78 
 
 
276 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  39.78 
 
 
276 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.07 
 
 
276 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.09 
 
 
277 aa  139  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  38.03 
 
 
271 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.22 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 
305 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  35.47 
 
 
273 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 
277 aa  122  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
324 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.37 
 
 
286 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 
332 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.39 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
271 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  31.95 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
341 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
331 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
279 aa  115  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.67 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  27.67 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 
315 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  35.32 
 
 
266 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  35.32 
 
 
266 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  35.32 
 
 
266 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  35.32 
 
 
266 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  35.32 
 
 
285 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 
261 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  34.87 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  31.9 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  35.32 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
292 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  32.67 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.93 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4947  extracellular solute-binding protein family 3  32.83 
 
 
345 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0229057  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  34.89 
 
 
266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  34.89 
 
 
266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
270 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  34.33 
 
 
266 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  34.89 
 
 
266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.8 
 
 
265 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.91 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  33.05 
 
 
323 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  31.65 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1454  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
389 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.758875  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.99 
 
 
288 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  35.42 
 
 
266 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 
344 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 
323 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  35.02 
 
 
264 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
260 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  31.86 
 
 
304 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
268 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 
278 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.14 
 
 
257 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
285 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  30.53 
 
 
290 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0246  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
359 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4005  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
389 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431376  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.14 
 
 
257 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.43 
 
 
278 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
302 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  29.79 
 
 
283 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  35.18 
 
 
271 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2558  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.41 
 
 
338 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
276 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  31.54 
 
 
282 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
250 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
266 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  32.35 
 
 
266 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  28.29 
 
 
294 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
271 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  33.19 
 
 
264 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4546  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 
336 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0715  extracellular solute-binding protein family 3  30.63 
 
 
362 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.337122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>